EC-CUBE 3.0では、アップデートやマイグレーション（移行ツール）の機能を搭載しました。
万が一、脆弱性が発見されたとしても、もうバージョン毎のパッチと、自社のカスタマイズの差分を確認しながら、1つ1つ対応する必要はありません。

システム上では、本体のソースコードだけでなく、EC-CUBEが利用している外部ライブラリも含め再検討を行い、PHPの多くのアプリケーションで実績のあるSymfony Component 2を開発の基板としたMicro-FrameworkのSilexを採用しました。

EC-CUBEが9年間かけて培ってきた数多くの機能、その全てに見直しを行いました。
ECの主要機能である「商品・顧客・受注」に関わる機能をEC-CUBE 3.0の「コア機能」として独立。その他の機能は、プラグインエンジンを利用して提供されます。

今後提供される各機能のAPIも、SFAやCRM、EDIといった他のWebサービスと連携した自由なショップ構築をサポートします。

EC-CUBE 3.0は構築時だけでなく、日々の運用やショップの状況の確認、そして新施策の実施までスピーディーに展開が可能です。

SmartyからTwigに変更されたテンプレートエンジンは、フォームやページ数が多くなりがちなECシステムをパーツ単位に分解し、コードの再利用性やデザインとの融合効率を向上。
マルチデバイスに対応した管理画面は、外出先でもショップの売上や在庫を確認でき、日々の運用効率を改善、意思決定をサポートします。
さらに、プラグインエンジンで、新しい機能を素早く追加します。